Eine Hochdurchsatz-DNA-Sequenzierungsplattform

Begründung des Auftraggebers

Das gewählte Material entspricht zum jetzigen und voraussehbaren Zeitpunkt am ehesten unseren finanziellen Mitteln und Bedürfnissen (Sicherung der Investitionen) unter Berücksichtigung der schnellen Entwicklung der Anforderungen in der Forschung.

Beschreibung

Die EPFL beabsichtigt, eine Hochdurchsatz-DNA-Sequenzierungsplattform für ihre Gene Expression Core Facility (GECF / PTEG) der Fakultät für Lebenswissenschaften (FSV) anzuschaffen. Diese Ausrüstung wird gemeinsam mit der Genomics Technology Facility (GTF) der Universität Lausanne betrieben und soll der modernsten Forschung im Bereich der funktionalen Genomik dienen.
Ein besonderer Schwerpunkt liegt auf RNA-seq und Epigenomik-Profilierung sowohl auf Einzelzell- als auch auf Bulk-Niveau, aber auch auf Genom- und Exom-Sequenzierung.
Dieses Gerät soll einen mittleren bis hohen Durchsatz ermöglichen und typischerweise sowohl mittelgroße als auch große Projekte sequenzieren können. Der angestrebte optimale Durchsatz liegt daher bei mindestens 5 bis 10 Milliarden Reads pro einzelnem Run.